Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms