Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms