Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms