Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME5P56597 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME5P56597 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms