Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms