Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms