Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms