Protein–RNA interactions for Protein: P36551

CPOX, Oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOXP36551 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPOXP36551 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPOXP36551 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CPOXP36551 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms