Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms