Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFNP31947 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFNP31947 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFNP31947 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms