Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms