Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms