Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms