Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms