Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms