Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSFA2P28290 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms