Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms