Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5F1P24539 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms