Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD247P20963 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD247P20963 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms