Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms