Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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