Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRP12270 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRP12270 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRP12270 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRP12270 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRP12270 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRP12270 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRP12270 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms