Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DMDP11532 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DMDP11532 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DMDP11532 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DMDP11532 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DMDP11532 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DMDP11532 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms