Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHGAP10645 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHGAP10645 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHGAP10645 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms