Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRB1P04280 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRB1P04280 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRB1P04280 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRB1P04280 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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