Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTA1P02549 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTA1P02549 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms