Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms