Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRATO95237 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRATO95237 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRATO95237 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms