Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEBLO76041 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEBLO76041 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEBLO76041 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms