Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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