Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSH5O43196 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSH5O43196 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSH5O43196 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSH5O43196 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSH5O43196 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms