Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms