Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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