Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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