Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms