Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms