Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms