Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms