Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms