Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms