Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG6Q9Y2V7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG6Q9Y2V7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms