Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SATB2Q9UPW6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms