Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms