Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms