Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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