Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms