Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHMP1AQ9HD42 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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