Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms