Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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