Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP1Q9C000 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms